Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms