Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms