Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r85G3UW56 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms