Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms