Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc6F8VPZ5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms