Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colca2F8VPY8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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