Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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