Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm3371F7CQW8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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