Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm28038F7BCN9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm28038F7BCN9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm28038F7BCN9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm28038F7BCN9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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