Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2564F6Z9S8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2564F6Z9S8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2564F6Z9S8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms