Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms