Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pagr1bF6V0H0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms