Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms