Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd7E9Q9W7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms