Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms