Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms