Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17175E9Q528 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17175E9Q528 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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