Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms