Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3250E9Q1M3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms