Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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