Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms