Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3095E9Q058 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms