Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms