Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms