Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5415E9PXF3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms