Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms