Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc8E9PWG2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc8E9PWG2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms