Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms