Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms