Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms