Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cngb1E1AZ71 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cngb1E1AZ71 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cngb1E1AZ71 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cngb1E1AZ71 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cngb1E1AZ71 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cngb1E1AZ71 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cngb1E1AZ71 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cngb1E1AZ71 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cngb1E1AZ71 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms