Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms