Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms