Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms