Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms