Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kpna7C0LLJ0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms