Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pnldc1B2RXZ1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms