Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabrr3B2RXA8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabrr3B2RXA8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms