Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms