Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms