Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms