Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usf3B2RUQ2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms