Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms