Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H60cB1B213 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms