Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms