Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms