Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2c2A7L9Z8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2c2A7L9Z8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms