Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prr16A3KMN5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prr16A3KMN5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms