Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm5640A3KG49 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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