Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Atp8b5A3FIN4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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